Tras la Era Mesozoica, la Era Cenozoica hizo su aparición hace 65 millones de años, tras el cataclismo que llevó a los dinosaurios a la extinción. Se dividió en dos periodos (uno de ellos partido en dos), y nuevas especies aparecieron debido a la extinción de todos los dinosaurios y pterosaurios, algunos mamíferos y algunas aves y gran parte de las especies marinas. El primero se denominaba periodo Terciario, estando dividido en dos: Terciario inferior (65 ma - 23,5 ma) y Terciario superior (23,5 ma - 1,75 ma). En el Terciario inferior, o "Paleogéno", comenzó el dominio de los mamíferos, viviendo en climas cálidos. (Ej.: Uintatherium, Ambulocetus, Icaronycteris). El Terciario superior, o "Neógeno", gigantescas aves carnívoras (como Titanus) aparecieron, siendo los superdepredadores de los ecosistemas cenozoicos. El clima se enfrió y la Antártida y los polos fueron cubiertos por placas de hielo. Comenzaron a existir los primeros elefantes primitivos, como Phiomia, junto con los primeros antepasados de los felinos. El periodo Cuaternario (1,75 ma) fue el más fructífero de toda la Era, donde comenzó a existir la famosa "Glaciación" y donde los continentes ya alcanzaban casi su posición actual. Cordilleras como los Andes o el Himalaya emergieron de la Tierra, junto con famosísimas especies como el mamut lanudo, el "tigre dientes de sable" o el rinoceronte lanudo que poblaron la Tierra, todos ellos adaptados al frío y al hielo siempre presente. Algunas especies de ellas existieron hasta hace relativamente poco, pero la llegada del ser humano llevó a la extinción a especies como el "dodo" (Raphus cucullatus) a finales del siglo XVII.
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